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从法律角度，你没有义务撤销投诉。你作为劳动者，有权向劳动监察部门投诉公司的违法行为，以保护自己的合法权益。撤销投诉是你的个人选择，不应受到任何胁迫或不当影响。如果劳动局正在调查，你可以配合提供相关证据和信息，以帮助劳动局更好地了解事实情况。
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如果你不撤销投诉，老板可能面临以下后果：一是劳动局可能会对公司进行罚款，以惩罚其违法行为；二是老板需要支付被克扣的工资及可能的赔偿金给员工；三是公司的声誉可能受损，影响未来的业务合作和员工招聘。具体后果取决于劳动局的调查结果和法律规定。
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如果你撤销投诉，劳动局是否继续调查取决于具体情况。根据《劳动法》的相关规定，劳动监察部门有责任保障劳动者的合法权益，不受克扣或无故拖欠工资等侵害。如果你撤销投诉，且劳动局尚未掌握足够证据或认为无需进一步调查，他们可能会停止调查。但如果劳动局认为有必要继续调查以维护公共利益或防止类似行为再次发生，他们仍可能继续进行调查。因此，撤销投诉并不一定会导致劳动局停止调查。